中科生信云平台发布 全国多组学技术应用高端论坛召开

2019年8月08日 17:35:44 来源: 分析测试百科
收藏到BLOG

  分析测试百科网讯 2019年8月8日,由上海中科新生命生物科技有限中马堂30码期期中主办的“第一届全国多组学技术及应用高端论坛暨中科新生命生信培训班”在上海举行。本次论坛展示了蛋白质组和代谢组在多组学和生命大数据背景下的最新30码期期中进展,促进行业内各30码期期中领域的交流与合作,加强行业信息资源的共享与成果转化,邀请了各30码期期中领域的专家、学者共研蛋白质组和代谢组的新技术和新思路,探讨大数据背景下的组学未来发展方向。同期,还将举办中科新生命十五周年用户答谢会及蛋白质组和代谢组生信培训班,吸引了近200位行业同仁参与。分析测试百科网作为本次活动的支持媒体,全程跟踪报道。

第一届全国多组学技术及应用高端论坛现场

中科院上海生命科学30码期期中院副院长廖侃30码期期中员致辞

  中科新生命成立于2004年,前身是中科院上海生命科学30码期期中院蛋白质组30码期期中分析中心。目前中科新生命已建立科技服务(蛋白/修饰/代谢30码期期中)、生物医药表征确证及精准医疗三大服务平台。中科院上海生命科学30码期期中院副院长廖侃在致辞中表示,“中科新生命从最开始的数十人到现在的数百名员工、年销售额过亿,我们一步步见证了中科新生命的蓬勃发展,可喜可贺。我预祝本次全国多组学技术及应用高端论坛顺利召开,并取得圆满成功,各参会人员都能有所收获。”

中科新生命副总经理 谢永明博士

  中科新生命副总经理谢永明博士上台致欢迎辞,对莅临本次活动的各位领导和专家表示衷心的感谢。谢永明表示:“随着系统生物学与多组学技术的快速发展,恰逢中科新生命成立15周年之际,特别举办本次多组学技术及应用高端论坛暨中科新生命生信培训班,为各领域的行业专家提供一个交流平台。最后,预祝本次大会能圆满成功,祝前来参加的各位老师能有所思、有所获、有所感。”

北美华人质谱学会主席、普渡大学终身教授、东南大学陶纬国教授

  北美华人质谱学会主席、普渡大学终身教授、东南大学陶纬国教授带来题为《Functional Proteomics:from Lab to Clinic》的精彩报告。

  陶纬国教授介绍了他们实验室开展的关于西红柿磷酸化组学及生物学信息的30码期期中项目,开发了一系列植物磷酸化的方法,并指出植物的磷酸化程度高于动物的磷酸化水平。由于植物的光合作用,其高丰度蛋白、细胞壁厚度、复杂代谢物等都是磷酸化30码期期中的难点,对此,陶纬国教授30码期期中团队开发了通用的植物磷酸化分析和蛋白质富集方法。

  陶教授还详细介绍了该实验室将磷酸化组学检测和外泌体30码期期中相结合,开展了基于外泌体中蛋白质磷酸化组变化的肿瘤生物标志物的30码期期中,并取得突破性进展。

中科院上海营养健康30码期期中院博士生导师 尹慧勇30码期期中员

  中科院上海营养健康30码期期中院博士生导师尹慧勇30码期期中员带来题为《代谢组学与心血管疾病》的精彩报告。

  代谢组学是系统30码期期中特定生物体系的所有代谢物,其中核磁共振和质谱是2种常见的代谢组学30码期期中技术。代谢组学在生物医学30码期期中中主要应用于生物标志物的发现和提供相关病理机制的线索。代谢组学技术能发现与某疾病相关的生物化学途径,发现可用于疾病诊断的生物标志物。报告介绍了基于质谱的代谢组学技术分析血浆中胆固醇的代谢、脂质氧化产物等,30码期期中心血管疾病的靶标和风险控制。

郑州大学第一附属医院肝病30码期期中中心 高洁博士

  郑州大学第一附属医院肝病30码期期中中心的高洁博士带来题为《蛋白质组学及代谢组学联合分析肝癌发生发展机制》的精彩报告。

  原发性肝癌主要指肝细胞癌,是常见的恶性肿瘤之一,具有恶性度高、预后差和死亡率高等特点。肝癌的致病原因多样,目前针对肝癌有多种治疗手段,但疗效提高有限。随着理论及检测手段的快速发展,在基因组学基础上衍生的多种组学的联合30码期期中使更深层次地认识、理解多种疾病的发生、发展乃至生物进化成为可能。

盛京医院卫生部先天畸形重点实验室博士生导师 袁正伟教授

  盛京医院卫生部先天畸形重点实验室博士生导师袁正伟教授带来题为《多组学技术在出生缺陷早期诊断分子标志物筛查的应用》的精彩报告。

  出生缺陷是导致全世界范围内产儿和婴幼儿死亡和儿童残疾的主要原因。袁正伟教授介绍了使用无创产前诊断DNA、蛋白质分子标志物进行筛查的应用实例。

  产前诊断分子标志物30码期期中,可通过各种组学技术系统筛选不同层次分子标志物,生物信息学技术对各种组学检测结果进行贯通交互分析;在大规模、多中心的队列中能验证分子标志物。人工智能技术可对分子标志物优化、筛选并建立计算机预警与诊断模型。

  在本次论坛上,中科新生命举行“中科新生命生物信息学平台”首次发布会。该云平台解决方案通过丰富的分析工具接入与精心打磨的交互式分析界面,有效降低科研项目生信分析的难度,提升科研效率,助力30码期期中项目进度稳定推进!

参会嘉宾共同启动中科生信云平台

中科新生命生物信息学平台负责人 尚婧

  中科新生命生物信息学平台负责人尚婧为现场参会代表介绍“中科生物信息学云分析平台”。

  中科生物信息学云分析平台希望能从促进生物数据的积累和共享,降低计算资源浪费,满足用户个性化需求,简化生物数据的再利用和重分析过程多方面服务于科研工作者。该平台具有云计算模型,用户友好(图形界面一键式操作零基础生信分析),个性化定制(按需定制个性化数据展示),安全稳定(多层安全防护/多重数据备份/保障数据安全完整)等优势。通过选择方法,上传数据,配置参数,运行返回结果这4步即可进行操作。

  生信云平台后续还将开发共表达网络、互作网络图、趋势聚类等分析工具,二期还将增加基因组学、转录组学、蛋白组学、代谢组学等分析流程。

  本次会议上,中科新生命联合扬州大学农学院小麦遗传及分子育种实验室举行战略合作签约仪式,双方将在小麦抗病遗传30码期期中方面进行合作,优势互补,相互支持,共同创新。

中科新生命副总经理谢永明博士与扬州大学农学院博士生导师李韬教授共同签署战略合作协议

福建农林大学蛋白质组学30码期期中中心主任 陈伟教授

  福建农林大学蛋白质组学30码期期中中心主任陈伟教授带来题为《A multilevel investigation to reveal the mechanism of salt tolerance in mangrove Kandelia candel》的精彩报告。

  陈伟教授的报告主要介绍了通过多层次30码期期中揭示红树林秋茄(Kandelia candel)耐盐机制,包括红树林植物的重要特征,酶活性和代谢物浓度,谷氨酸合成和植物代谢的途径,盐胁迫下的秋茄光合作用变化等。30码期期中结果显示,在一定量氯化钠的胁迫下,秋茄光合作用能保持稳定,植物能保持生长,增加的塑性球蛋白可能有助于在盐胁迫下保持膜的完整性和流动性。

中科新生命产品部经理 严峻博士

  中科新生命产品部经理严峻博士带来题为《质谱组学技术梳理》的精彩报告。

  中科新生命成立于2004年,目前提供包括蛋白组,修饰组,非靶向代谢组,靶向代谢组,脂质组,多组学联合分析,转录组及肠道微生物等30码期期中服务和支持。严峻博士分享了从经典的2D-MALDI,同位素标记和非标记蛋白质组学,非靶向代谢组、靶向代谢组、脂质组学、多组学联合分析,到最新的DIA全扫描定量蛋白质组分析的30码期期中思路和进展,并介绍了中科新生命与全国众多客户在生命科学、基础和临床医学等领域获得的30码期期中成果。

扬州大学农学院博士生导师 李韬教授

  扬州大学农学院博士生导师李韬教授带来题为《转录和蛋白组学在小麦抗病遗传中的应用》的精彩报告,内容包括混池转录组学在小麦光谱抗性基因定位中的应用和混池蛋白组学挖掘小麦赤霉病抗性/赤霉菌致病性相关基因。综合应用混池转录组测序(BSR-Seq)、SNP芯片以及参考基因组信息,能提高图位克隆的效率,为候选基因的分析和功能30码期期中奠定了基础。

  通过在赤霉菌和小麦基因组测序,以及病原菌致病基因和寄主抗性基因(QTL)定位、挖掘和功能解析30码期期中。通过转录组学应用,获得赤霉菌侵染寄主小麦前后赤霉菌和寄主转录本变化及其信号路径。通过蛋白组学应用,围绕赤霉菌侵染小麦前后赤霉菌和小麦种蛋白的积累差异,在寄主方面围绕赤霉菌主效抗性QTL Fhb1开展30码期期中。

重庆医科大学附属第一医院精神科主治医师 周新雨副30码期期中员

  重庆医科大学附属第一医院精神科主治医师周新雨副30码期期中员带来题为《代谢组学在抑郁症30码期期中中的应用》的精彩报告,介绍了抑郁症代谢组学30码期期中的临床背景,抑郁症患者及动物模型的代谢组学30码期期中,全球首个抑郁症代谢数据库的建立。

  抑郁症诊断与治疗存在诊断困难,缺乏客观指标,机制不明、病因不清,无法寻找新的治疗靶点等困惑。代谢组学是继基因组学,蛋白质组学之后,从整体的角度,通过30码期期中生物体、器官或组织的内源性代谢物质的代谢途径及其所受内在环境因素影响及随时间变化规律的一门新兴学科。抑郁症代谢组学,可寻找诊断抑郁症的客观诊断标志物,寻找抑郁症治疗的新靶点,揭示抑郁症发生发展的生物学机制。

参会嘉宾合影